將施奈德回老家之后,四只原本親如兄弟的神龜由于沒(méi)有了敵人,于是不再想以往一樣一起戰(zhàn)斗,而是各自在喜歡的領(lǐng)域內(nèi)鉆研,以往一起行動(dòng)的忍者神龜們變成了四個(gè)獨(dú)來(lái)獨(dú)往的“獨(dú)行俠”! 這時(shí),紐約市中發(fā)生一連竄的怪事。原來(lái)實(shí)業(yè)家馬克西米林安?J?威特斯意圖征服紐約市,秘密培養(yǎng)了一支遠(yuǎn)古怪獸組成的軍隊(duì),加上惡名昭彰的忍者組織Foot Clan,各種黑暗勢(shì)力又在城市的角落里蠢蠢欲動(dòng)! 神龜們又處于備戰(zhàn)狀態(tài)了!他們?cè)俅温?lián)合起來(lái),準(zhǔn)備向黑暗勢(shì)力出擊!